Es elegido por la Asamblea Universitaria, es el ejecutor de las políticas estratégicas de gestión universitaria y dura en su cargo cuatro años, tiene entre otras funciones ejercer la conducción administrativa, económica y financiera de la Universidad, organizar las secretarías, orientar las actividades académicas, la representación de la Universidad y el ejercicio de la jurisdicción superior universitaria.
El cargo de Rector es Docente e impone dedicación exclusiva a la Universidad y su titular durará cuatro (4) años en sus funciones. El Vicerrector durará en sus funciones cuatro (4) años. Ambos pueden ser reelectos una sola vez
El rector es la máxima autoridad de la Universidad. Tiene a su cargo:
Constituye la máxima autoridad universitaria, se conforma con todos los Decanos y Consejeros Directivos por Facultades más los Consejeros Superiores, es presidida por el Rector de la Universidad,
se reúne en sesiones ordinarias y extraordinarias, tiene amplias atribuciones, por ejemplo elegir al Rector y Vicerrector.
Constituyen el máximo Órgano de Gobierno en cada Facultad, también tiene representación cuatripartita, (Docentes, Alumnos, Egresados y No Docentes) esta presidido por el Decano respectivo, los Consejeros Directivos cumplen funciones deliberativas y legislativas, le corresponde ejercer la jurisdicción superior de la Facultad, hacer cumplir las normas del Estatuto Universitario, y las que con carácter general haya establecido el Consejo Superior, entre otras atribuciones.